系統方面，與之前推出的飛利浦智能手機不同，飛利浦小飛俠S301并未搭載谷歌Android操作系統，而是采用了阿里巴巴YunOS，系統界面風格簡約、清新。對于看慣了Android智能手機的用戶來說，該機的界面確實可以給人一種眼前一亮的感覺，不過依然兼容海量的Android應用，可玩性高。
鎖屏界面和桌面界面
相對于谷歌Android智能手機而言，搭載YunOS的飛利浦小飛俠S301完全是全新的系統界面，整體設計風格更加簡約、輕盈，頗具美感。同時，這款手機還擁有多套本地主題和在線主題供用戶選擇，手機的壁紙、主題、字體、鈴聲以及鎖屏方式想換就換，充分滿足了當前用戶講究個性化的需求。
主題設置界面
桌面界面
需要指出的是，飛利浦小飛俠S301并沒有常見的“應用程序列表”界面，手機中的所有應用均位于桌面界面，用戶左右滑動即可方便查看，減少了二級菜單操作，類似于蘋果的iOS系統。
通知欄界面和任務管理界面
另外，這款手機擁有簡明的通知體系，手機的下拉通知欄潔凈有序，各類信息一覽無余，便于用戶日常使用。同時，飛利浦小飛俠S301還加入了個性的多任務管理中心，用戶可以輕松快捷的關閉多余應用，減少內存占用，可以有效節電、省流量，如圖所示。
