傳說，這是一個由神與神博弈爭論而形成的沙洲世界。
然而，上神的博弈卻造成了世界無盡的混沌，因此神便創造了“魂組織”，通過“魂斗士”對這個沙洲世界所有的靈魂秩序進行管理和維護，達到了沙洲世界的平衡。
“他”，是一個魂斗士，是一個被神所放棄的棋子。全世界都站到了“他”的對立面，作為魂組織最后的希望，即使敵人是整個世界，也只能奮起抵抗。
一個大沙盤，千千萬萬顆棋子，千千萬萬個被詛咒的靈魂在沙盤中生存。而管理這些棋子，那個好比規則手冊一般的存在，則被人們稱之為“魂斗士”。
魂斗士管理沙盤上千年，平穩的生活持續了上千年。直到一個神奇的宗教——“輪回宗”的興起。輪回宗打著消滅魂組織的旗號，來的迅猛，就好像病毒一般在整個沙盤中迅速擴散。沒用多久，整個世界便都站到了輪回宗的一邊。
乍看起來，輪回宗只是因為教義和魂組織對立才會敵對魂斗士，但其實背后還有更大的陰謀。一次秘密調查任務，他發現了輪回宗秘密謀劃的陰謀，但也由于其行動敗露，與同伴一起被捕。雖然后來在同伴的掩護下逃脫出來，但此時的魂組織已經因為輪回宗的陰謀陷入幾近完全瓦解的狀態。
逃脫途中，“他”的魂鏡被敵人擊碎?；赙R是魂斗士的命脈，魂鏡的損壞對魂斗士來說是致命的。不過“他”很幸運，并沒有因為魂鏡的損壞而死去，但是“他”的記憶也隨著魂鏡的破碎消失掉了……
他自己已經身處狀況之外，但世界都與他為敵的情況依然沒有改變。他的命運到底會如何？魂組織是否能再現曾經的榮光？輪回宗的驚天密謀到底是什么？
